东方红湿地国家级自然保护区
位于黑龙江省东部虎林市境内，乌苏里江中游，完达山南麓，东接乌苏里江干流与俄罗斯接壤，是三江平原沼泽湿地集中分布地区之一。湿地内主要河流有独木河、大木河，最后汇入乌苏里江，是乌苏里江流域中游重要水源保护地和涵养地。湿地内分布有东方白鹳、丹顶鹤、东北虎、紫貂等珍稀濒危动植物物种，是东北亚地区重要的水鸟繁殖地和迁徙停栖地。
-宝清七星河国家级自然保护区
位于三江平原腹地，乌苏里江左岸，全区在双鸭山市宝清县境内，距离宝清县城70公里。这里属于内陆湿地和水域生态系统类型保护区，总面积2万公顷，核心区7960公顷。河流泡沼星罗棋布，地貌特征为“两草一水七分苇”，像一块绿宝石镶嵌在三江平原上，是国际上鸟类迁徙的重要通道。
-扎龙国家级自然保护区
是目前世界上野生丹顶鹤种群数量最多的繁殖栖息地。保护区野生动植物资源十分丰富，具有高等植物468种，鸟类269种，尤以鹤的种类多而著名，全世界鹤类有15种，我国分布9种，保护区有6种，野生丹顶鹤种群数量稳定在近300只左右。
-兴凯湖国家级自然保护区
其范围为：保护区西起白棱河口，北邻穆棱河，东北与虎林市交界，东以松阿察河、南以大兴凯湖与俄罗斯相接，总面积222488公顷。保护区的鸟类一共有289种，其中国家一级保护鸟类11种；兴凯湖大白鱼、兴凯松是兴凯湖特有品种。这里为东亚—澳大利亚候鸟迁徙通道大量的候鸟提供了重要的停歇、繁殖地,候鸟迁徙量在150-200万只。
-珍宝岛湿地国家级自然保护区
地处三江平原东部，乌苏里江中游西侧，与俄罗斯隔江相望，总面积44364公顷。有“中国野生荷花之乡”、“黑龙江十大最美湿地”、“中国森林氧吧”称号。保护区内生态系统类型多样，既有湿地生态系统、草甸生态系统，又有森林生态系统。被国内外专家定性为最具原始性、观赏性、复合性和代表性的沼泽生态系统。
-洪河国家级自然保护区
位于三江平原腹地，地跨同江市与抚远县两个行政区域，总面积2183.7公顷。主要有以保护水生、湿生和陆生生物和生态环境共同组成的湿地生态系统以及东方白鹳、丹顶鹤、白枕鹤、大天鹅等珍稀濒危野生动物。
-南瓮河国家级自然保护区
地处大兴安岭东部林区伊勒呼里山南麓，是黑龙江大兴安岭地区目前唯一的国际重要湿地。保护区为“内陆湿地和水域生态系统类型”，区内森林面积147751公顷，湿地面积80916公顷，是嫩江的主要发源地和水源涵养地。保护区内野生植物1046种、兽类49种、鸟类216种、两栖爬行动物和鱼类44种，几乎囊括了大兴安岭寒温带针叶林区所有的陆生、湿生、水生生物物种。
-三江国家级自然保护区
位于三江平原的东北角，地跨抚远、同江两县市，总面积198089公顷，是黑龙江和乌苏里江汇合的三角地带，属内陆湿地和水域生态系统类型自然保护区。大小河流57条，分属黑龙江、乌苏里江两大水系。湖泡204个，江心岛屿26个。野生动植物资源有兽类、鸟类、爬行类、两栖类、昆虫、鱼类，有高等植物1000余种。
-友好国家级自然保护区
地处小兴安岭山脉的中段，友好林业局境内，横跨小兴安岭山脉的南、北两坡，总面积60687公顷，属自然生态系统类、内陆湿地和水域生态系统类型，湿地主要保护对象是东北林区沼泽湿地生态系统。湿地内河漫滩平坦开阔，牛轭湖、热融湖众多，大小泡沼星罗棋布，土壤永冻层分布普遍，气候寒冷湿润，为各类沼泽的发育奠定了良好的环境基础，形成了多种沼泽湿地类型，具有北方山地沼泽湿地生态系统的典型特征。植被类型多样，是一个重要的物种遗传“基因库”。
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