imagej可以作图吗(如何使用imagej作图)

各位读者朋友们又见面了,今天给大家介绍一款图片处理软件——ImageJ,这是一款免费的科学图像分析工具,广泛应用于生物学研究领域。ImageJ软件能够对图像进行缩放、旋转、扭曲、模糊等处理,也可计算选定区域内分析对象的一系列几何特征,包括长度、角度、周长、面积、长轴、短轴等等。更重要的是ImageJ的处理结果受到各种杂志的广泛认可,不会出现造假的问题。下面介绍ImageJ的常用功能。

软件下载链接:

***/download/imagej/windows/post-download

软件下载解压后可直接使用,还是先看一下ImageJ的界面,非常简洁明了,有多种图形和文字处理工具,可谓麻雀虽小五脏俱全。下面还是举例说明软件的常用功能。

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

1. 图像基本变换

单击菜单【File】→【Open】打开图像文件,以大兴机场图片(中间为原始图片)为例,对图像进行4种基本处理,操作如下:

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

a. 平滑处理:单击菜单【Process】→【Smooth】,单击菜单【File】→【Save As】选择图像格式(左);

b. 锐化处理:单击菜单【Process】→【Sharpen】,单击菜单【File】→【Save As】选择图像格式(右);

c. 改变图像类型:单击菜单【Image】→【Type】→选择图像类型(图中为8-bit)单击菜单【File】→【Save As】选择图像格式(上);

d. 色彩平衡:单击菜单【Image】→【Ajust】→【Color Balance】,单击菜单【File】→【Save As】选择图像格式(下)。

除了上述处理之外,ImageJ还能对图像进行旋转、缩放等操作,读者可一一尝试,在此不再赘述。

2. 细胞计数

ImageJ能够很方便地记录图片上的粒子个数,如细胞、病斑、孢子等等,下面以人体红细胞图片为例说明计数方法。

a. 改变图像模式,打开图片,单击菜单【Image】→【Type】→【8 bit】,将图片转化成8位的灰度图;

b. 调整图片对比度,单击菜单【Image】→【Ajust】→【Brightness/Contrast】,将图片调整到合适的对比度,这里用了Auto来自动调整;

c. (可选)若图片背景为黑色,则可单击菜单【Edit】→【Invert】,将图片变为白底;

d. 由于计数时只需要黑白两种颜色,单击菜单【Image】→【Ajust】→【Threthold】,用阈值算法将颜色合并来调整,这里也用了Auto来自动调整;

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

e. 得到上述图片后,先要确定图片中粒子大小,这里小编介绍一种简单办法,单击菜单【Analyze】→【Measure Panicles】,将粒子大小设置为1进行预计算,得到平均粒子大小186.7,然后以这个数值作为粒子大小重新计数,就能得到比较准确的粒子数目了。

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

3. 条带灰度分析

ImageJ另外一个重要的功能是条带灰度值分析(DNA或Western Blot条带),下面讲解具体做法。

a. 打开条带图片,单击菜单【Image】→【Type】→【8 bit】,将图片转化成8位的灰度图;

b. 矩形工具选择要分析的条带,单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Select First Lane】,选中后矩形框内会出现1的符号;

c. 单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Plot Lanes】,得到初始峰图;

d. 用工具栏中的直线工具将峰图下方封口,使其成为几个独立的区域,用魔棒工具分别点击这几个独立的区域,得到最后的灰度值统计结果;

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

e. 测量多个条带的灰度值,可拖动图中的矩形框,选中下一行条带,单击菜单【Analyze】→【Gels】→【Select Next Lane】,选中所有条带后,同样使用直线工具封口,魔棒工具点击各区域得到面积,即灰度值;

f. 对数据做归一化处理,这里由于16-20为对照,分别用1-15每个条带的灰度值除以相应的对照,得到归一化的灰度值;

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

g. 最后在excel中整理数据,并在Prism中画出相应的柱状图。(关于Prism的使用,请参看科研论文作图之Graphpad Prism)

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

4. 图片导出

ImageJ的图片导出十分简单,单击菜单【File】→【Save As】,有Tiff, Gif, Png等各种常用的图片格式,读者可根据需要自行选择。

关于ImageJ,不得不去了解的作图干货

好了,ImageJ的使用就给大家带来到这,另外给大家提供一个视频教程:

***/course_video/Image-J-kuai-su-ru-men-ji-ji-ben-cao761484.html

声明:本网页内容旨在传播知识,若有侵权等问题请及时与本网联系,我们将在第一时间删除处理。E-MAIL:dandanxi6@qq.com

(0)
上一篇 2023年 9月 22日 下午1:19
下一篇 2023年 9月 22日 下午1:25

相关推荐

  • qq平台针对严重违规及多次违规行为的治理公告怎么写

    QQ平台一直致力于打造安全、健康、绿色的平台生态环境,持续对平台内发生的各类违法违规行为进行重点关注、坚决处理、严厉打击。 欺诈、赌博、色情低俗、侵害未成年、违禁品营销等违法违规行…

    2023年 5月 27日
  • 这6个免费ppt模板网站,绝对不能错过

    今天这期内容给大家推荐6个免费PPT模板网站,有PPT背景、PPT素材、PPT模板、PPT课件等丰富资源。模板直接套用,对于不会做PPT的新手朋友,真的是非常友好。 1、菜鸟图库 …

    2023年 6月 2日
  • 如何免费扫描照片文字转换为word

    扫描图片转word怎么转?扫描图片转Word是一项非常重要的任务,它能够将图像转换为可编辑的文本格式,使其更易于编辑、复制和共享。在现代社会中,电子文档的使用已经变得越来越普遍,因…

    2023年 8月 25日
  • wps关闭热点和广告推送的设置方法是

    WPS一直是深受国内用户喜爱的办公软件,相比微软的Office系列,其某些功能设计更符合我们中国人的使用习惯,最重要的是WPS提供了个人使用的免费版,不像微软一直都是收费的,很多人…

    2023年 5月 5日
  • 利用蒙版和画笔制作飞溅效果,如何用黑色画笔涂抹蒙版

    制作动感喷溅的方法非常实用,过程:先把人像单独抠出来,方法任意,并更换想要的背景;然后把抠出的人物图像复制一层,用液化或变形工具在需要加效果的区域做变形处理;最后用蒙版及喷溅笔刷增…

    2023年 10月 8日
  • windows10对游戏的支持

    前几天小编分享了Windows10游戏用户请看过来,希望对你有所帮助(一),为了帮助用户更好地使用Windows10系统,现延续之前的内容,小编现为大家分享Windows10游戏遇…

    2023年 7月 14日
  • 30个影源秒切换,它才是真正的手机追剧之王

    国庆长假后的第一个周末来了! 学霸君又能继续摊在家追剧了。 不过之前安利的追剧软件,过一段时间就会有小伙伴吐槽:“学霸君,你那个软件不能用了!” 身心疲惫的学霸君,决定把我珍藏多年…

    2023年 7月 8日
  • html的表格标签有哪些

    大概在2000年以前,也就是web 1.0时代,表格就是我们的一种布局方式。 在web 2.0时代,网页重构的浪潮中,表格布局被DIV+CSS布局所代替。 但是不代表表格无用,表格…

    2023年 7月 6日
  • 怎么通过wxid加微信好友(如何用微信原始wxid加好友)

    为什么附近的人能够能够轻而易举的加上微信?摇一摇被加上的可能性其实是很小的,那么在一个人群聚集区怎么会被加上好友?或者说我们普通人怎么避免被微信“骚扰”?有一个最简单的办法就是把微…

    2023年 7月 18日
  • 微信小技巧,4个简单小步骤,领取你的网上身份证是什么

    过年期间大家都要面临各种出行问题,有时候难免会丢三落四,尤其是身份证,紧急需要的时候找不到会非常麻烦,这个时候大家就可以通过电子身份证来进行验证。 而如果你还不知道电子身份证该如何…

    2023年 5月 25日